NGS 3.0
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NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) Il Next Generation Sequencing è una tecnologia di sequenziamento high-throughput per l’analisi di un altissimo numero di frammenti in parallelo. Esistono diverse piattaforme per la tecnologia NGS, ma con un comune workflow: PREPARAZIONE DEL CAMPIONE E DELLA LIBRARY DI SEQUENZIAMENTO Il campione di DNA o RNA, dopo frammentazione meccanica o enzimatica, viene ligato a sequenze adapter per ancorare i frammenti al supporto di sequenziamento. I frammenti ligati costituiscono la “Sequencing Library” (libreria di sequenziamento). È possibile sequenziare interi...

Il sequenziamento whole-transcriptome è possibile dopo deplezione degli RNA ribosomali, che rappresentano l’85-90% dell’RNA totale e possono quindi interferire con l’analisi. Il sequenziamento dei soli mRNA può essere ottenuto con la pre-selezione dei poly-A-RNA. smallRNA-Seq/miRNA-Seq: il sequenziamento NGS di smallRNA e microRNA consente di ottenere un profilo di espressione qualitativo e/o quantitativo. Single-Cell/Low Input RNA-Seq: Il sequenziamento di RNA da singole cellule (10-30 pg di RNA totale; 1-5% mRNA) richiede metodi dedicati per la preparazione delle library, idealmente a...

01. PREPARAZIONE ACIDI NUCLEICI Zymo Research offre una tecnologia per l’isolamento di DNA Cell-Free (cfDNA) circolante. System Biosciences (SBI) propone un kit per l’isolamento e la caratterizzazione di esosomi da biofluidi in meno di 2 ore senza ultracentrifugazione. Inoltre, SBI offre un kit per l’estrazione simultanea di cfDNA e DNA da esosomi. NEB offre un sistema per l’arricchimento di DNA microbico da campioni contenenti DNA ospite metilato (compreso l’uomo) che mantiene inalterata la biodiversità microbica. Zymo Research presenta la linea dei prodotti ZymoBIOMICS™ per la purificazione...

NEBNEXT® dsDNA FRAGMENTASE® Frammentazione di dsDNA, tempo-dipendente per generare frammenti con overhang 5’-P e 3’-OH di 50-1.000 bp. Efficienza comparabile con i “sistemi meccanici” e possibilità di automazione. NEB propone il kit NEBNext® per NGS Library Prep (Illumina® e Ion Torrent™), per DNA-Seq, RNA-Seq (direzionale e non), smallRNA-Seq, ChIP-Seq, da minime quantità (500 pg di DNA, 5 ng di RNA), Enzymatic Methyl-Seq (10-200 ng di gDNA) compatibili con automazione. Zymo Research offre kit per Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) e 5-hmC genome-wide a partire rispettivamente da 10...

MAGTIVIO BEADS BIOPTIC Qsep FRAGMENT ANALYZER Le bead magnetiche MagSi-NGSPREP Plus per Size Selection, compatibili con l’automazione, hanno rese e protocollo sovrapponibili alle beads comunemente utilizzate. Bioptic propone sistemi per analisi rapida e accurata di smear di library NGS, frammenti di DNA, gDNA/ gRNA e proteine. La tecnologia innovativa CGE, basata su cartucce facilmente intercambiabili, garantisce la massima flessibilità operativa (1-96 campioni). Disponibile in 3 versioni con diverso throughput (Qsep1, Qsep100, Qsep400). SERA-MAG™ SELECT GE Healthcare offre le biglie...

NEBNEXT LIBRARY QUANT KIT SERVIZI DI ANALISI BIOINFORMATICA E NGS Sistema ad alta sensibilità per la quantificazione di library NGS Illumina mediante qPCR. Il Kit contiene primer per gli adaptor Illumina P5 e P7 e standard per la quantificazione tra 150 e 1000 bp (NEBioCalculator.neb. com) Euroclone offre su richiesta Servizi di Analisi Bioinformatica per LETTORI A FLUORESCENZA BMG LABTECH Strumenti in grado di quantificare fluorofori intercalanti nel dsDNA (50 – 100 ng/µl) in piastre da 96 pozzetti. • RNA-Seq (QC, mappaggio, annotazione) • Single Cell RNA-Seq (QC, cluster, marcatori) •...

Quick-cfRNA™ Serum & Plasma Euroclone SpinNAker Plasmid DNA Miniprep Kit Euroclone SpinNAker Universal Genomic DNA Mini Kit Euroclone SpinNAker Gel&Pcr DNA Purification Kit Eurogold Trifast Nucleic Acids Isolation Reagent Monarch® Total RNA Mini Kit QUICK-cfDNA™ SERUM & PLASMA ZYMO RESEARCH Kit Specifico per isolamento di cell free DNA da biofluidi Kit per l’estrazione di acidi nucleici NEB MONARCH® NEW ENGLANG BIOLABS SpinNAker EUROCLONE ExoQuick serum exosome precipitation solution QUICK-cfRNA™ SERUM & PLASMA ZYMO RESEARCH Isolamento di cell free RNA da biofluidi EXOQUICK E EXOQUICK-TC SYSTEM...